纳米技术及应用国家工程研究中心是经国家发展和改革委员会于2003年10月批准设立的，国内唯一一家国家级的纳米技术及应用工程研究中心。
中心依托由上海交通大学、复旦大学、华东师范大学、中科院上海微系统与信息技术研究所、中科院硅酸盐研究所、上海医药工业研究院、上海紫竹创业投资有限公司、上海宝钢集团公司、上海科技投资公司和上海市纳米科技与产业发展促进中心等十家发起单位共同出资组建而成的“上海纳米技术及国家工程就中心有限公司”进行管理。中心项目总投资1.82亿元人民币，其中国家投入8000万元，上海市政府配套6000万元，发起单位出资4200万，在2004年至2007年间均被列入上海市重大工程建设项目以及国家高新技术产业发展项目计划。
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